TWiV 1217: Альтернативные вакцины и происхождение пандемии

В выпуске This Week in Virology обсуждают нового руководителя CBER при FDA, закрытие фонда Гейтса в 2045 году, указ о приостановке исследований по усилению функций, происхождение вирусов летучих мышей, являющихся предками SARS-CoV и SARS-CoV-2, и однократную репликонную вакцину против вируса Судан.

Винни Акапрасад сменил Питера Маркса на посту директора CBER, что было воспринято как негативное событие из-за критических взглядов Акапрасада на фармацевтическую промышленность и меры против COVID-19. CBER (Центр оценки и исследований биологических препаратов) — необычное правительственное агентство с действующими исследовательскими лабораториями. CBER является частью FDA, которая занимается биологическими препаратами и одобряет биологические лекарства, включая вакцины, а также все белковые продукты, производимые в наши дни с помощью генетически модифицированных организмов. К ним относятся моноклональные антитела к инсулину, в то время как подразделение лекарственных средств и подразделение устройств занимаются другими аспектами.

Прасад сравнил Маркса с болванчиком, который только и делает, что ставит штампы об одобрении, что является несправедливым и не соответствующим действительности утверждением. Прасад — онколог и профессор в UCSF. Несмотря на его регалии, его взгляды на меры общественного здравоохранения во время пандемии были противоречивыми.

Во время COVID-19 Прасад решил, что он эксперт по COVID-19, и писал в Твиттере бессмыслицу, в которой ничего не понимал. Есть немало людей, которые подходят под эту категорию, когда смотришь на них на бумаге и говоришь: «О, ничего себе». Но человек, ставший экспертом в чем-то одном, часто решает, что он знает все, и рассуждает на многие темы, о которых ничего не знает.

В 2022 году Прасад и Макари стали соавторами статьи, в которой критиковали рекомендации по бустерным прививкам для подростков и молодых людей. Они пришли к выводу, что требование бустерных прививок для молодых людей принесет больше вреда, чем пользы, даже несмотря на то, что риски миокардита были намного ниже, чем при инфицировании. Это говорит о том, что потенциальные долгосрочные последствия не были учтены.

Назначение Прасада может встревожить производителей лекарств и вакцин, которые зависят от предсказуемости стандартов и процедур FDA. Больше всего бизнес не любит хаос. Непредсказуемость регулирования может нанести ущерб бизнесу, и назначение вызывает опасения по поводу будущих стандартов.

Фонд Гейтса прекратит свою деятельность в 2045 году, потратив все свои деньги в течение 20 лет. За первые 25 лет фонд выделил более 100 миллиардов долларов и выделит более чем в два раза больше в течение следующих двух десятилетий. Билл Гейтс был крайне критичен и возмущен прекращением действия программы USAID.

Фонду Хьюза удалось создать фонд на постоянной основе. Сомнительно, что Билл Гейтс хочет чего-то, будущее чего он не может предсказать или контролировать. Вместо этого он предпочитает сам определить, чем все это закончится.

У фонда Гейтса три ключевых стремления: чтобы ни одна мать, ребенок или младенец не умирали от предотвратимых причин; чтобы следующее поколение выросло в мире без смертельных инфекционных заболеваний; и чтобы сотни миллионов людей вырвались из нищеты. Его, должно быть, действительно беспокоит нынешняя тенденция в США только с корью, где зарегистрировано почти 1000 подтвержденных случаев. Единственная проблема заключается в том, что он все еще собирается вкладывать деньги в искоренение полиомиелита, где им необходимо изменить свой подход.

Президент издал указ, ограничивающий исследования по усилению функций и опасные исследования по усилению функций.

Определения взяты из прошлогоднего документа администрации Байдена. Опасное усиление функций означает научные исследования инфекционного агента, способного вызывать заболевания путем повышения его патогенности или увеличения его трансмиссивности. Важно отметить, что никто не знает, как это сделать.

Администрация Байдена разрешила опасные исследования по усилению функций в Соединенных Штатах с недостаточным уровнем надзора. Нынешняя администрация прекратит федеральное финансирование любому, кто не ведет себя так, как они хотят. Они просто заметили, что есть категория исследований, которую они могли бы легко закрыть, не оправдывая ничего, просто сказав, что мы собираемся сделать это более безопасным, запретив весь этот набор исследовательских проектов.

Искоренение оспы и происхождение вирусов SARS-CoV

Прошло 45 лет с тех пор, как оспа была объявлена искорененной. На следующей неделе, 14 мая, отмечается день искоренения оспы, когда Эдвард Дженнер в 1796 году привил Джеймса Фиппса, инициировав первые эксперименты с вакцинацией против оспы.

В статье, опубликованной в журнале Cell, обсуждаются недавность и географическое происхождение вирусов летучих мышей, являющихся предками SARS-CoV-2 и SARS-CoV-1. Исследование включало в себя анализ имеющихся данных о вирусных последовательностях и построение филогенетических деревьев для определения происхождения вирусных линий. В состав этой международной команды входят представители Эдинбургского университета, Калифорнийского университета в Сан-Диего в Ла-Холье, Токийского университета, Университета Глазго, Оксфордского университета, Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе, Научно-исследовательского института Скриппса в Ла-Холье, Университета Редимерс в штате Осун, Нигерия, Университета Тулейн в Новом Орлеане, Калифорнийского университета в Ирвайне, Гонконгского университета, Китайского фонда зеленого развития биоразнообразия в Пекине, Бразильского университета в Брюсселе, Лёвенского католического университета в Лёвене, Бельгия, и Аризонского университета в Тусоне.

При калибровке молекулярных часов исследователи учитывали способность вирусов к рекомбинации. Результаты показывают, что и SARS-CoV-1, и SARS-CoV-2 произошли от коронавирусов подковоносых летучих мышей, которые циркулировали за один-шесть лет до появления у человека. Это еще одно опровержение теорий заговора об утечке из лаборатории как источнике любого коронавируса SARS.

Непосредственные предки обоих вирусов перемещались быстрее, чем обычные перемещения подковоносых летучих мышей, что указывает на причастность торговли дикими животными к распространению. И чтобы усилить этот последний момент, я хотел бы отметить, что финансирование поступало также из всех этих стран, включая, я полагаю, значительную сумму из США. Поэтому это подчеркивает важность продолжения изучения вирусов летучих мышей, а также случаев распространения на других животных, особенно тех, которые перевозятся для использования человеком.

Вероятно, вирусы передавались через другой вид. Определение времени циркуляции предка этих вирусов — важная информация.

Если просто взять целые геномные последовательности и сравнить все эти вирусы, то это проблема, потому что эти вирусы интенсивно рекомбинируют. Наиболее распространенный недавний предок SARS-CoV-2, использующий длинные геномные фрагменты, дает оценку в 30–40 лет до 2019 года. Поэтому, когда вы делаете эти сравнения целых геномов, не принимая во внимание рекомбинацию, вы получаете число, которое не является надежным.

В этой статье определены нерекомбинирующие области (НРO) для установления молекулярных часов и оценки времени циркуляции предка. И SARS-1, и SARS-2, вероятно, возникли далеко от мест циркуляции и слишком быстро достигли городов, где они появились. В обоих случаях должна быть одинаковая ситуация.

Пространственно-временное распространение вирусов и разработка вакцин

Ученые изучают пространственно-временное распространение двух вирусов у летучих мышей. Линии пространственно структурированы: аналогичные вирусы отбираются в географически схожих регионах, с очень небольшими перемещениями туда-сюда по довольно большим регионам исследуемой области. Это имеет смысл с точки зрения поведения подковоносых летучих мышей в биологии.

Ближайшие предполагаемые предки SARS-1 циркулировали в западном Китае, в то время как SARS-CoV-2 — в Юньнани или северном Лаосе. И SARS-1, и SARS-CoV-2 появились у людей более чем в 1000 километрах от мест циркуляции их ближайших предков-вирусов, обнаруженных у летучих мышей. Эти регионы совпадают с районами, где наблюдается наибольшее разнообразие видов подковоносых летучих мышей, откуда и происходят эти вирусы.

Вирусы, подобные SARS-CoV-1, распространялись со скоростью 1666 квадратных километров в год, а SARS-CoV-2 — со скоростью 740 квадратных километров в год. Эти вирусы циркулируют в этих регионах тысячи лет. Это означает, что вирус переходит к соседнему, затем к следующему соседнему и так далее, распространяясь на пару тысяч квадратных километров.

Перенос инфицированных животных, таких как пальмовые циветты, с участием человека, вероятно, привел к появлению SARS-1. Перевозка инфицированных животных на большие расстояния может объяснить скорость распространения. Считается, что в случае SARS-1 перемещение пальмовых циветт и енотовидных собак в рамках этой торговли животными привело к появлению вируса.

Эпицентр SARS-CoV-2 находился на одном из четырех рынков в Ухане, где продавали диких животных, являющихся вероятными промежуточными хозяевами. Предок переместился из окружающей провинции в район вокруг или в провинцию Юньнань в Хубэй через торговлю дикими и сельскохозяйственными животными. Эти два вируса и их предки циркулировали у подковоносых летучих мышей в сотнях-тысячах километров от мест их появления.

В статье, опубликованной в журнале Nature Communications, обсуждается однократная репликонная РНК-вакцина против вируса Судан, которая обеспечивает единообразную защиту самок морских свинок от заболевания. Вирус Судан — это филовирус из рода вируса Эбола. В настоящее время не существует одобренных вакцин или методов лечения этого вируса.

Исследователи использовали РНК-конструкцию, которая может реплицироваться после попадания в клетки, в отличие от нереплицирующихся мРНК-вакцин. Использование реплицирующейся РНК имеет ряд потенциальных преимуществ перед нереплицирующейся мРНК, включая возможность обеспечения защитного иммунитета с помощью одной дозы. Это имело бы решающее значение для остановки быстро распространяющейся вспышки вируса Судан.

Исследователи присоединили РНК-репликон к локализующей катионной наноносительной форме, или LION. Вакцина вызывает сильный ответ антител и защищает всех морских свинок от смерти при заражении вирусом через три недели. Защита опосредована не только нейтрализацией, но и FC-опосредованными функциями.

Это многообещающая доклиническая демонстрация платформы вакцин, которая может быть эффективной в борьбе не только с вирусом Судан, но и с другими филовирусами. Этот подход был применен, и в Японии уже была лицензирована вакцина. Эта РНК может попасть в клетку, может воспроизводить больше себе подобных в этой клетке и повышать свою эффективную дозу в этой клетке, чтобы вы получили хорошую экспрессию белка, так что это все еще путешествие в один конец.

Команда TWIV размышляла о последних новостях и исследованиях, включая необходимость готовности, а также потенциал новых вакцин.